Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL13Q9P2N7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms