Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RDH8Q9NYR8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RDH8Q9NYR8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RDH8Q9NYR8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RDH8Q9NYR8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RDH8Q9NYR8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RDH8Q9NYR8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RDH8Q9NYR8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RDH8Q9NYR8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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