Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP7BPQ9NSQ0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RRP7BPQ9NSQ0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms