Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBP3Q9NS15 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBP3Q9NS15 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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