Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms