Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC31BQ9NQW1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC31BQ9NQW1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms