Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ASCL3Q9NQ33 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms