Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC17Q9NP64 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC17Q9NP64 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms