Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms