Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDRD3Q9H7E2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms