Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 BCAS2P3-201ENST00000416374 767 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 IL12A-205ENST00000480787 863 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 ZNF30-AS1-201ENST00000604333 625 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP3Q9H4L4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AC010834.3-201ENST00000520562 939 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AC098483.1-202ENST00000436515 967 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 POLR2K-201ENST00000353107 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP3Q9H4L4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms