Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RSPH6AQ9H0K4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RSPH6AQ9H0K4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms