Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms