Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H5

ARHGAP39, Rho GTPase-activating protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP39Q9C0H5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGAP39Q9C0H5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms