Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX6-2Q9C056 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms