Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms