Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDHR2Q9BYE9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR2Q9BYE9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms