Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABARAPL3Q9BY60 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms