Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms