Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms