Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms