Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS1Q99742 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPAS1Q99742 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPAS1Q99742 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPAS1Q99742 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS1Q99742 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS1Q99742 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS1Q99742 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS1Q99742 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS1Q99742 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS1Q99742 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS1Q99742 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms