Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAT1Q99536 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms