Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMD1Q99460 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMD1Q99460 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms