Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRAMP1Q96RY5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms