Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NUDCD1Q96RS6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUDCD1Q96RS6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms