Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CICQ96RK0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CICQ96RK0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms