Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A9Q96Q91 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A9Q96Q91 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms