Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C8orf49Q96NF6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C8orf49Q96NF6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C8orf49Q96NF6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C8orf49Q96NF6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C8orf49Q96NF6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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