Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E2Q96LR5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E2Q96LR5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms