Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EP400Q96L91 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EP400Q96L91 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms