Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPZA3Q96KX2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms