Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM71F1Q96KD3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms