Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LRIG1Q96JA1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRIG1Q96JA1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms