Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM4SF18Q96CE8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms