Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX21Q969T3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms