Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRF1Q92994 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRF1Q92994 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms