Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARPC1AQ92747 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms