Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF3Q92576 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms