Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBXN4Q92575 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN4Q92575 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms