Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
TOPBP1Q92547 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TOPBP1Q92547 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms