Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAAF4Q8WXU2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms