Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC12Q8WUD4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms