Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF548Q8NEK5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF548Q8NEK5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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