Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP4Q8N3C7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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