Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC9A9Q8IVB4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A9Q8IVB4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms