Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP13Q86W25 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP13Q86W25 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms