Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD6Q6ZV73 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FGD6Q6ZV73 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FGD6Q6ZV73 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FGD6Q6ZV73 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FGD6Q6ZV73 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FGD6Q6ZV73 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
FGD6Q6ZV73 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FGD6Q6ZV73 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGD6Q6ZV73 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGD6Q6ZV73 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGD6Q6ZV73 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGD6Q6ZV73 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGD6Q6ZV73 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGD6Q6ZV73 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms