Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC9Q6ZRR7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC9Q6ZRR7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms