Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNE3Q6ZMZ3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms